Единая информационная служба
+7 (8182) 21-61-07

Вычислительный кластер

 

В главном корпусе Северного (Арктического) Федерального Университета имени М. В. Ломоносова установлен кластер компании Fujitsu для поддержки научно-исследовательской и образовательной деятельности университета.

Институт математики, информационных и космических технологий был одним из инициаторов его приобретения. Высокопроизводительные вычисления являются одним из основных направлений института. САФУ является членом Суперкомпьютерного консорциума университетов России. Ключевым мероприятием в этом направлении, проводимым институтом, является ежегодная международная молодежная научно-практическая школа «Высокопроизводительные вычисления на Grid системах».

Описание кластера

Вычислительный кластер компании Fujitsu обладает следующими характеристиками:

  • 20 вычислительных узлов.
  • На каждом узле установлено 2 десятиядерных процессора Intel Xeon и 64 ГБ ОЗУ.
  • На восьми узлах дополнительно установлены математические сопроцессоры Intel Xeon Phi 5110P.
  • Внутренняя компьютерная сеть для вычислений: Infiniband 56 Гб/с.
  • Сетевая файловая система FEFS (Fujitsu Exabyte File System) объёмом более 50 ТБ и пропускной способностью 1,67 ГБ/с (13,36 Гб/с).
  • Производительность кластера на CPU в тесте LINPACK 8,02 Tflops; на CPU+Xeon Phi 7,68 Tflops, совокупная 15,7 Tflops.
Прикладные программные пакеты

ANSYS

Для научно-исследовательских и образовательных целей закуплены лицензии на программное обеспечение ANSYS. Наличие сетевых лицензий позволяет установить ANSYS на ваши рабочие компьютеры в сети университета, а ресурсоёмкие задачи отправлять на кластер (для многих модулей это можно сделать прямо из Workbench настройкой одного параметра).

В первом полугодии 2014 года проведено пробное решение задач гидрогазодинамики в рамках выпускной квалификационной работы бакалавра. Полученные результаты дополнительно оформлены как методические рекомендации по работе с программным обеспечением ANSYS на кластере САФУ. Проводится межинститутский научно-практический семинар «Использование ANSYS на кластере САФУ».

OpenFOAM

Для научно-исследовательских и образовательных целей установлен свободно распространяемый инструментарий вычислительной гидродинамики — пакет OpenFoam.

Quantum Espresso

Для научно-исследовательских задач в области квантовой химии установлен программный пакет Quantum Espresso.

MCCC Towhee

Для молекулярного моделирования методом Монте Карло.

LAMMPS

Свободный пакет для классической молекулярной динамики. Пакет может применяться для крупных расчётов (до десятков миллионов атомов).

NWChem

Назначение пакета NWChem — обеспечить своих пользователей высоко масштабируемыми средствами вычислительной химии, которые способны эффективно решать большие научные задачи вычислительной химии вне зависимости от имеющихся параллельных вычислительных ресурсов от высокопроизводительных параллельных суперкомпьютеров до кластеров из обычных рабочих станций.

NWChem программное обеспечение может решать задачи, связанные с вычислениями: биомолекул, наноструктур, и твердотельные состояния; квантовых и классических моделей, и любые их комбинации; гауссовских базисных функций или плоских-волн с масштабируемостью от одного до нескольких тысяч процессоров; свойства и относительность вычислимых структур.

SALOME

Открытая интегрируемая платформа для численного моделирования. Представляет собой набор пре- и постпроцессинга.

ParaView

ParaView — открытый графический кросс-платформенный пакет для интерактивной визуализации в исследовательских целях.

Пакет поддерживает клиент-серверную архитектуру для организации удалённой визуализации массивов данных и использует метод уровня детализации (level of detail, LOD) для поддержки визуализации больших объёмов данных в интерактивном режиме. Пакет ParaView реализован на базе библиотеки VTK, Visualization Tool Kit. Пакет ParaView разрабатывался для осуществления параллелизма данных на компьютерах с общей, распределённой памятью и кластеров. При этом ParaView может использоваться и на персональных компьютерах.

Пакет ParaView предоставляет пользователю возможности интерактивной визуализации и исследования больших массивов данных для качественного и количественного анализа. Работа с пакетом может осуществляться как в интерактивном, так и пакетном режиме.

Контакты

Дополнительные консультации по сопровождению научно-исследовательских проектов с использованием суперкомпьютерных технологий можно получить в центре инновационного обучения и на кафедре прикладной математики и высокопроизводительных вычислений ИМИКТ.

Организационные вопросы: директор центра инновационного обучения Юфрякова Ольга Алексеевна o.yufryakova@narfu.ru

Техническая поддержка: ведущий инженер программист кафедры прикладной математики и высокопроизводительных вычислений Рудалёв Александр Васильевич a.rudalev@narfu.ru

СМИ о кластере САФУ
Дата изменения страницы 21.12.2015